Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms