Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREML1Q86YW5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms