Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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