Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYS1Q717R9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms