Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC141Q6ZP82 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms