Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms