Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms