Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP350Q5VT06 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms