Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms