Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms