Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms