Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ODF3L2Q3SX64 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms