Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms