Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms