Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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PTCH1Q13635 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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