Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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