Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM32Q13049 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms