Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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