Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms