Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms