Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NCS1P62166 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NCS1P62166 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NCS1P62166 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NCS1P62166 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NCS1P62166 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NCS1P62166 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NCS1P62166 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NCS1P62166 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NCS1P62166 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NCS1P62166 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms