Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00315P59091 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms