Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC13P55735 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC13P55735 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC13P55735 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC13P55735 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEC13P55735 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC13P55735 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms