Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSBP45954 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms