Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GJC1P36383 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GJC1P36383 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GJC1P36383 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms