Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.9 ms