Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBRP28336 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBRP28336 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBRP28336 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBRP28336 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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