Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms