Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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