Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DGG1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DGG1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
B4DGG1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
B4DGG1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4DGG1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4DGG1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
B4DGG1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4DGG1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
B4DGG1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms