Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KNCNA6PVL3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms