Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GMNCA6NCL1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms