Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms