Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4B1Q9Y6B7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms