Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX11Q9Y5W9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX11Q9Y5W9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms