Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms