Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HDGFL3Q9Y3E1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HDGFL3Q9Y3E1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDGFL3Q9Y3E1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms