Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT52Q9Y366 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms