Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2D4Q9Y2X8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D4Q9Y2X8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms