Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D2

SLC35A3, UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3Q9Y2D2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35A3Q9Y2D2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A3Q9Y2D2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A3Q9Y2D2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A3Q9Y2D2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A3Q9Y2D2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A3Q9Y2D2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A3Q9Y2D2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A3Q9Y2D2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A3Q9Y2D2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A3Q9Y2D2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A3Q9Y2D2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A3Q9Y2D2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35A3Q9Y2D2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35A3Q9Y2D2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35A3Q9Y2D2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms