Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TNNQ9UQP3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNNQ9UQP3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNNQ9UQP3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNQ9UQP3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms