Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH4Q9UQ05 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH4Q9UQ05 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH4Q9UQ05 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH4Q9UQ05 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH4Q9UQ05 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH4Q9UQ05 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH4Q9UQ05 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH4Q9UQ05 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH4Q9UQ05 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH4Q9UQ05 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms