Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAPRE3Q9UPY8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAPRE3Q9UPY8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAPRE3Q9UPY8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms