Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EDARQ9UNE0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EDARQ9UNE0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms