Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX12Q9UMY4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX12Q9UMY4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX12Q9UMY4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX12Q9UMY4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX12Q9UMY4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX12Q9UMY4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX12Q9UMY4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX12Q9UMY4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX12Q9UMY4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX12Q9UMY4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX12Q9UMY4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX12Q9UMY4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX12Q9UMY4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX12Q9UMY4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX12Q9UMY4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms