Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIMS3Q9UJD0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms