Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS8

RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF14Q9UBS8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF14Q9UBS8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF14Q9UBS8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms