Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPASTQ9UBP0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPASTQ9UBP0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms