Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD4Q9NZQ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD4Q9NZQ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD4Q9NZQ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
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