Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCKIPSDQ9NZQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms